94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0735 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  100 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  62.73 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  57.58 
 
 		 258 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  46.61 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  43.48 
 
 		 249 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  44.12 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  41.4 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  40 
 
 		 215 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  43.48 
 
 		 219 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  40.93 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.69 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.15 
 
 		 248 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.87 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.85 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.91 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.91 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.86 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  40.82 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.48 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.13 
 
 		 276 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.13 
 
 		 276 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  35.88 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  35.88 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  35.88 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  35.88 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  35.88 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  35.88 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  35.88 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  35.88 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  35.88 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.88 
 
 		 278 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.92 
 
 		 278 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.29 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.64 
 
 		 267 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.29 
 
 		 266 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  34.25 
 
 		 276 aa  89  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.32 
 
 		 278 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.82 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.98 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.47 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  33.12 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.46 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.82 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.62 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.92 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.4 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.4 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.93 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  31.37 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.58 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.9 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.15 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  33.8 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  37.14 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.67 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.16 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.98 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  23.71 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.29 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.63 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.81 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.57 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.51 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  25.77 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.09 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.57 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.68 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  27.39 
 
 		 358 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  32.74 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  26.42 
 
 		 329 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.05 
 
 		 329 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.57 
 
 		 349 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  22.17 
 
 		 334 aa  48.5  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.03 
 
 		 372 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  24.77 
 
 		 332 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.71 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  22.8 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.9 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.75 
 
 		 358 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  22.49 
 
 		 334 aa  46.6  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  21.15 
 
 		 325 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  34.18 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.04 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  26.44 
 
 		 349 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  26.92 
 
 		 364 aa  45.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.99 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  26.28 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.73 
 
 		 349 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  21.67 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.38 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  32.26 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 		 396 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05732  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06950)  24.86 
 
 		 437 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1526  Lipoate-protein ligase A-like protein  27.5 
 
 		 246 aa  42  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0848084  normal  0.0690433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>