66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1526 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1526  Lipoate-protein ligase A-like protein  100 
 
 
246 aa  500  1e-140  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0848084  normal  0.0690433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.94 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.87 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.91 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  29.17 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  29.17 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  29.17 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  29.17 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  29.17 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  29.17 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  29.17 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  29.17 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  29.17 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.07 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.7 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.17 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.3 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  28.29 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.35 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.81 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.81 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.14 
 
 
275 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.51 
 
 
280 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.52 
 
 
273 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.32 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.32 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.35 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.32 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  25.49 
 
 
276 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.76 
 
 
252 aa  58.9  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.28 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.17 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.4 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.39 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.4 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.65 
 
 
271 aa  55.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  26.83 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  31.25 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  28.05 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.39 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  26.14 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  25.99 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  26.53 
 
 
235 aa  52.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  25.42 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.5 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  27.5 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.65 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.65 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.83 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.4 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.32 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  26.9 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  29.59 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.87 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  26.67 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.27 
 
 
275 aa  48.9  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.11 
 
 
276 aa  48.5  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0558  hypothetical protein  26.42 
 
 
239 aa  47  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  26.88 
 
 
215 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  28.8 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  30.72 
 
 
349 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  26.38 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.68 
 
 
358 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.17 
 
 
261 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  27.78 
 
 
358 aa  42  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>