113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1629 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  63.67 
 
 		 264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  64.26 
 
 		 281 aa  315  6e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.52 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  54.07 
 
 		 269 aa  301  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  49.23 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  47.49 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.48 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.04 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.01 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.03 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.77 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.13 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.13 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.81 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.83 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.16 
 
 		 236 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  35.87 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.7 
 
 		 236 aa  99.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.62 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.18 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.65 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.28 
 
 		 267 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.69 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  31.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  31.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  31.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  31.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  31.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  31.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  31.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  31.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  31.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.35 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.41 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.39 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.5 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.11 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  28.14 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.12 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.02 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.83 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  26.84 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.81 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.69 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.85 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.21 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.87 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.59 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.95 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.4 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  34.03 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.14 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  29.31 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  29.41 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  28.9 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  29.45 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.96 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.96 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.86 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  33.57 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  30.71 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  31.43 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  32.39 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  24.52 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  31.17 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.25 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  28.8 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  24.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.73 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.73 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0440  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.1 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_002620  TC0558  hypothetical protein  26.13 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  24.6 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.22 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  22.75 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.29 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  23.08 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.77 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.91 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  20.85 
 
 		 363 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  22.88 
 
 		 334 aa  49.3  0.00006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.87 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  26.8 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  22.07 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  29.94 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2611  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.7 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  25.52 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.03 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1254  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.87 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  26.43 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.71 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  26.67 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  21.78 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  26.67 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  26.67 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.41 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.67 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>