82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_05951 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  92.24 
 
 		 250 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  85.58 
 
 		 228 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  67.91 
 
 		 215 aa  307  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  43.13 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  42.52 
 
 		 248 aa  177  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  40.87 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  42.66 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  45.73 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  43.48 
 
 		 232 aa  160  9e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  45.98 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.38 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  41.85 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.23 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  32.42 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.55 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.55 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.93 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.64 
 
 		 278 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.89 
 
 		 278 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.87 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.62 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.07 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.75 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.75 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  30.49 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  29.21 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.57 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.69 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.69 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.47 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.94 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.5 
 
 		 278 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.42 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  30.94 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  28.04 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  30.94 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  30.94 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  30.94 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  30.94 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  30.94 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  28.04 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  30.94 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.53 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.57 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.16 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.04 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  29.79 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.26 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.8 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.22 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.95 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.05 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  32.12 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.23 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.88 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.43 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.18 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.49 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.57 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  31.48 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  29.45 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.14 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  29.71 
 
 		 364 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  28.78 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.63 
 
 		 372 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.5 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.17 
 
 		 329 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.19 
 
 		 354 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.95 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  27.88 
 
 		 334 aa  45.4  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  28.17 
 
 		 358 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.58 
 
 		 365 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.5 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.68 
 
 		 329 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.32 
 
 		 358 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.25 
 
 		 349 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.88 
 
 		 261 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1526  Lipoate-protein ligase A-like protein  26.95 
 
 		 246 aa  42  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0848084  normal  0.0690433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>