117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1329 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 245 aa  506  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  48.17 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  44.83 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.95 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.54 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  43.75 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.83 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.86 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.86 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  42.01 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  42.86 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  41.76 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  42.77 
 
 		 278 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  41.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.3 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.29 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.81 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.72 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.36 
 
 		 248 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.82 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.68 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.27 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.8 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  34.48 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.36 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.1 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  33 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  34.66 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  34.48 
 
 		 281 aa  95.5  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  32.24 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.2 
 
 		 280 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  29.38 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.24 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  33.71 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  32.76 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  32.09 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  33.52 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.02 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.89 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.43 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  33.87 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.02 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.07 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  33.52 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  30.7 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.96 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.46 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  35.81 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.4 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.06 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  31.01 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.79 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.79 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.03 
 
 		 269 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1254  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.16 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.32 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.63 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0440  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.97 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1526  Lipoate-protein ligase A-like protein  28.3 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0848084  normal  0.0690433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0262  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.79 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0487982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.66 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  28.65 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0267  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.16 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556601 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.32 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  29.07 
 
 		 329 aa  52  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.95 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.95 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.51 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.92 
 
 		 325 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  25 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  25.48 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  26.32 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.91 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.26 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  27.27 
 
 		 329 aa  49.3  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.27 
 
 		 349 aa  48.5  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3968  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.19 
 
 		 198 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  25.52 
 
 		 329 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  24.42 
 
 		 331 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  25.52 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  25.52 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  25.52 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  25.52 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  25.52 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.52 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.35 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  29.51 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  25.52 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  25.52 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  25.52 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>