42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0267 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0267  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
237 aa  460  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000556601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0262  biotin/lipoate A/B protein ligase  97.89 
 
 
237 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0487982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3968  biotin/lipoate A/B protein ligase  61.05 
 
 
198 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0440  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.78 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  30 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.26 
 
 
261 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.37 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1254  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.43 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  29.72 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.7 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.16 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  24.2 
 
 
278 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  24.2 
 
 
278 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  24.2 
 
 
278 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  24.2 
 
 
278 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  24.2 
 
 
278 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  24.2 
 
 
278 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  24.2 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  24.2 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  23.74 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.21 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.74 
 
 
278 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  28.77 
 
 
281 aa  48.9  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.45 
 
 
255 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.29 
 
 
278 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.97 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.97 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.74 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.47 
 
 
283 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  21.76 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.75 
 
 
275 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.36 
 
 
349 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.01 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.63 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  26.63 
 
 
364 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  25.11 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.26 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.07 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.48 
 
 
262 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.26 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.36 
 
 
349 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.85 
 
 
252 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>