164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4031 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 349 aa  692    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  65.62 
 
 		 349 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  63.04 
 
 		 349 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  61.49 
 
 		 372 aa  431  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  62.99 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  59.6 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  59.31 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  62.75 
 
 		 365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  61.45 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  56.37 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.98 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  65.13 
 
 		 261 aa  348  9e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  65.76 
 
 		 261 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  65.62 
 
 		 257 aa  341  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.2 
 
 		 259 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  55.66 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02600  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.43 
 
 		 530 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  36.36 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0964  hypothetical protein  63.33 
 
 		 91 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.27883  normal  0.241278 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.33 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1515  hypothetical protein  66.3 
 
 		 94 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.648993  hitchhiker  0.00942142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3412  hypothetical protein  63.33 
 
 		 94 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.010842  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.78 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.44 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  28.64 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0451  hypothetical protein  58.89 
 
 		 92 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.24 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.54 
 
 		 329 aa  93.2  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.78 
 
 		 273 aa  92.8  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  26.09 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.26 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  30.12 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.72 
 
 		 325 aa  90.1  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.32 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.44 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  31.44 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  27.76 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  26.1 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  26.91 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  28.92 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.98 
 
 		 276 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.98 
 
 		 276 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  28.73 
 
 		 269 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.24 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.99 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.91 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.1 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.37 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  29.03 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  29.03 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  29.03 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  29.03 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  29.03 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.03 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.47 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  29.03 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  29.03 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  29.03 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  24.8 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  24.18 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  24.18 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  24.69 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.03 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.1 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  28.49 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  25.49 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  28.05 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  30.88 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.69 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.69 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.81 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  23.81 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  23.81 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  23.81 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  23.81 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  28.24 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  25.9 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  23.81 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  23.81 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  23.81 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.75 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.28 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.17 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.24 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.25 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  25.42 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.56 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  29.72 
 
 		 562 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.57 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.53 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  28.08 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  28.06 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.68 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.49 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  29.25 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  29.25 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  29.25 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  29.25 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  29.25 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>