16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02600  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  431  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  53.57 
 
 
354 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  54.07 
 
 
364 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  53.03 
 
 
349 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  52.27 
 
 
349 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  51.8 
 
 
372 aa  131  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  46.97 
 
 
349 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  51.52 
 
 
352 aa  122  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  50 
 
 
365 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  50 
 
 
349 aa  114  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  44.52 
 
 
358 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  45.27 
 
 
358 aa  92.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0964  hypothetical protein  53.68 
 
 
91 aa  92.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.27883  normal  0.241278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0451  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3412  hypothetical protein  47.87 
 
 
94 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.010842  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1515  hypothetical protein  48.94 
 
 
94 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.648993  hitchhiker  0.00942142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>