17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1515 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1515  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.648993  hitchhiker  0.00942142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3412  hypothetical protein  88.04 
 
 		 94 aa  163  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.010842  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0964  hypothetical protein  62.64 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.27883  normal  0.241278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  66.3 
 
 		 349 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  60 
 
 		 349 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  64.18 
 
 		 358 aa  87  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.84 
 
 		 354 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.67 
 
 		 365 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0451  hypothetical protein  56.04 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  52.22 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  72.73 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  46.67 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  51.11 
 
 		 352 aa  78.2  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  52.81 
 
 		 372 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02600  hypothetical protein  48.94 
 
 		 220 aa  77  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  41.94 
 
 		 364 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.44 
 
 		 360 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>