147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0399 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  92.11 
 
 		 267 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.06 
 
 		 280 aa  288  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.65 
 
 		 275 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.25 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  51.91 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  55.13 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  34.55 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  34.55 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.09 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.09 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  34.18 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  34.18 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  34.18 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  34.18 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  34.18 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  34.18 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  34.18 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.82 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.6 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.09 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  31.23 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.7 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  34.39 
 
 		 245 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.21 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  32 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.48 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.4 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.84 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.18 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.11 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.59 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.6 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.15 
 
 		 237 aa  95.9  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.81 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  31.71 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  34.3 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.11 
 
 		 530 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.56 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  32.49 
 
 		 235 aa  92  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.48 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.71 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.91 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.42 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  30.29 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.57 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.61 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.3 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.72 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  34.27 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.49 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.07 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  35 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.55 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.77 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.87 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.04 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.87 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  27.94 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.94 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  24.54 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.61 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.4 
 
 		 327 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  24.16 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  24.16 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  24.16 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  24.16 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  24.16 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  30.3 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  24.16 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  26.02 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.16 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  29.83 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  24.16 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.15 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.22 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.15 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.79 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  23.79 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  23.79 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.38 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  29.29 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.49 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.83 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.9 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  27.43 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  28.24 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.05 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  24.09 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.13 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.19 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.37 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  25.47 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  25.87 
 
 		 326 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.65 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  27.53 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  29.57 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  24.14 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  28.65 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>