162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2238 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  55.85 
 
 		 275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  51.91 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  49.81 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  51.91 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  52.09 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  50 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.61 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.06 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  32.08 
 
 		 245 aa  142  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  30.74 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  30 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  30.74 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  30.74 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  30.74 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  30.74 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  30.74 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  30.74 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  30 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  30.37 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  30.37 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  27.68 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.15 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.15 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.2 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.19 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.97 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.82 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.96 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.83 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.77 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.15 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.13 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.17 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.1 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.13 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.69 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.09 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.7 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.7 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  32.2 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.97 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.18 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.34 
 
 		 261 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.57 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  28 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  35.8 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  23.97 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.82 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  26.45 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.73 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.07 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  26.92 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.67 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.95 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.73 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.67 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  31.2 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  25 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.57 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  28.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  28.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  28.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  28.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  28.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  31.86 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  28.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  28.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  28.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  25.7 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.05 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  30.22 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.56 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  30.8 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  24.19 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  29.02 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  34.1 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  28.1 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.15 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  26.47 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.64 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.94 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.12 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  27.45 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.43 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.64 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.38 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  26.8 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.24 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  28.9 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  26.44 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  27.84 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  25.11 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  22 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.86 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.45 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  29.82 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  24.9 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  25 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>