108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1628 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  60.52 
 
 		 232 aa  275  4e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  57.21 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  46.46 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  39.74 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  41.26 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  43.78 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  43.13 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  45.69 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  44.56 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  45.88 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  43.2 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.42 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  46.15 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  41.71 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.73 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.73 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  38.97 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.36 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.36 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  37.06 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  37.06 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  37.06 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  37.06 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  37.06 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  37.06 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  37.06 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  37.06 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  37.06 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.06 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.66 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.29 
 
 		 278 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.47 
 
 		 278 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  29.92 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.69 
 
 		 278 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.47 
 
 		 276 aa  86.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.05 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.87 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.89 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  30.95 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.04 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.89 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.15 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.78 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  35 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.8 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  36.07 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.42 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.26 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.79 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.86 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.74 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.2 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.62 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  25.54 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.78 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  32.58 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  28.73 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.9 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.14 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.57 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.42 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  29.45 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.17 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.89 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  23.71 
 
 		 333 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  24.85 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  25 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.48 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.48 
 
 		 358 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.27 
 
 		 329 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.22 
 
 		 327 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  26.72 
 
 		 329 aa  48.9  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  24.85 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  29.82 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.83 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  25 
 
 		 334 aa  46.6  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  28.37 
 
 		 337 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.31 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  30 
 
 		 372 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.84 
 
 		 357 aa  46.2  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05732  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06950)  25.99 
 
 		 437 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25 
 
 		 329 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  27.04 
 
 		 289 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0558  hypothetical protein  23.76 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  23.9 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  23.9 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  23.9 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  23.9 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  23.9 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  23.9 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  23.9 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  23.9 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.54 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  30 
 
 		 349 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.9 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  26.04 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  23.4 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.63 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>