85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_05651 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  92.24 
 
 
219 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  85.96 
 
 
228 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  68.4 
 
 
215 aa  306  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  43.98 
 
 
242 aa  188  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  42.61 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  41.51 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  41.3 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  41.74 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  41.4 
 
 
232 aa  168  8e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.59 
 
 
240 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  45.14 
 
 
252 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  41.9 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.66 
 
 
268 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  33.04 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.33 
 
 
268 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.33 
 
 
268 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.92 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.77 
 
 
278 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.09 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.54 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.05 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.16 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  29.63 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.54 
 
 
278 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.9 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  27.09 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  27.09 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  30 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  30 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  30 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  30 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  30 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  30 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  30 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.69 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.69 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  33.53 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.58 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.69 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.29 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.43 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.1 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.14 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.35 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  30.5 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.08 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.66 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.15 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.07 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.11 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.69 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  30 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.9 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  32.12 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.86 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.89 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.39 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  28.74 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.9 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.75 
 
 
349 aa  52.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  28.33 
 
 
269 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.81 
 
 
238 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  30.91 
 
 
349 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  28.47 
 
 
364 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.88 
 
 
354 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.37 
 
 
372 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  28.06 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.11 
 
 
329 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  25.9 
 
 
329 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  28.17 
 
 
358 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.95 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.83 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.85 
 
 
365 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.71 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  24.1 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  25.18 
 
 
334 aa  43.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  25 
 
 
358 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.71 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1526  Lipoate-protein ligase A-like protein  26.83 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0848084  normal  0.0690433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  25.87 
 
 
329 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.49 
 
 
343 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>