69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2150 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
255 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  71.07 
 
 
268 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  71.07 
 
 
268 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  52.24 
 
 
252 aa  249  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  51.05 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  49.37 
 
 
248 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  49.36 
 
 
268 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  40.1 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  42.08 
 
 
232 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  36.67 
 
 
258 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  32.93 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  31.71 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  35.62 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  32.34 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  35.93 
 
 
219 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  34.92 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  37.71 
 
 
215 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.92 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  32.98 
 
 
228 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.9 
 
 
276 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.9 
 
 
276 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  29.39 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  28.79 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  28.79 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  28.79 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  28.79 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  28.79 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  28.79 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  28.79 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  28.41 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.51 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  28.41 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.79 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.14 
 
 
276 aa  89  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.38 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.6 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.6 
 
 
278 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.66 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.49 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.98 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.9 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.56 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.68 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  30.46 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  29.73 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.81 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.41 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  28 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.06 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.51 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.4 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  30.25 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  28 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.94 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.32 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.81 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.53 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.73 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.6 
 
 
271 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.13 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.79 
 
 
530 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.97 
 
 
246 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0267  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.45 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000556601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0262  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.28 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0487982  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.47 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.19 
 
 
343 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.77 
 
 
349 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>