94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1869 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  95.58 
 
 
249 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  47.26 
 
 
248 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  46.83 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  41.36 
 
 
242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  43.48 
 
 
232 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  41.74 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  45.73 
 
 
219 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  43.54 
 
 
228 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  42.18 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  43.09 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  41.62 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.88 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.2 
 
 
268 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.93 
 
 
255 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.34 
 
 
268 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.22 
 
 
268 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  34.52 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.43 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.99 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.95 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.84 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.95 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.95 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  29.51 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  29.51 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  29.51 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  29.51 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  29.51 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  29.51 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.51 
 
 
278 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  29.51 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  29.51 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  29.51 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  32.37 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.69 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.74 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.63 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.63 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.11 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.81 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.45 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.43 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  30.59 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.72 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.9 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.39 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.34 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.14 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.41 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.82 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  28.17 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.51 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.5 
 
 
262 aa  58.5  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.32 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  28.5 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.09 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.61 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.51 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.14 
 
 
280 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.2 
 
 
345 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.42 
 
 
271 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  25.79 
 
 
334 aa  51.2  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.95 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.11 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  26.9 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  24.27 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.32 
 
 
329 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.32 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.71 
 
 
269 aa  48.5  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.17 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.13 
 
 
329 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  22.63 
 
 
334 aa  45.8  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  27.5 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1526  Lipoate-protein ligase A-like protein  25.66 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0848084  normal  0.0690433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.09 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58727  predicted protein  24.68 
 
 
475 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0291322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.12 
 
 
329 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.12 
 
 
329 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  25.32 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.49 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  28.12 
 
 
329 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  24.07 
 
 
326 aa  42.4  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  26.71 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.91 
 
 
358 aa  42  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  26.49 
 
 
332 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>