139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1527 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 274 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.52 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  59.51 
 
 		 281 aa  304  9.000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  55.77 
 
 		 264 aa  298  4e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  52.99 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  46.28 
 
 		 275 aa  247  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  44.62 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.03 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.03 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.8 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.11 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.78 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.17 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.23 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.07 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.32 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.32 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  29.41 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  29.33 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  29.33 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  29.33 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  29.33 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.91 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.33 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  29.33 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  29.33 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  29.33 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  29.33 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  29.33 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.8 
 
 		 245 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.84 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.89 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.73 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.58 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.61 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.18 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.57 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  31.52 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.72 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.35 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.14 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.82 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.79 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.66 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.14 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.55 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  29.95 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  30.59 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.12 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  35.51 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  33.33 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  29.28 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  25 
 
 		 530 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  32.43 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  34.44 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  33.33 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.79 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.07 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  30.71 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.91 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  28 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.04 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.91 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.4 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  32.16 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.11 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.17 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  23.17 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  29.82 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  26.88 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  26.92 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  26.16 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.14 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  25.62 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0440  biotin/lipoate A/B protein ligase  32 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.91 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  28.28 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0262  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.57 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0487982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  28.28 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  28.28 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  28.28 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  28.28 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  28.28 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  26.32 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  28.28 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  28.28 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  20.99 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.28 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  28.28 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  25 
 
 		 334 aa  57  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.71 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.59 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0267  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.37 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.86 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  25.48 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  26.52 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  24.57 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25 
 
 		 332 aa  52.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  27.53 
 
 		 364 aa  52  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>