171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2355 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  93.17 
 
 
278 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  70.14 
 
 
278 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  69.06 
 
 
278 aa  408  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  69.06 
 
 
278 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  69.06 
 
 
278 aa  408  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  69.06 
 
 
278 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  69.06 
 
 
278 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  69.06 
 
 
278 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  69.06 
 
 
278 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  69.06 
 
 
278 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  69.06 
 
 
278 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  69.06 
 
 
278 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  65.45 
 
 
276 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  65.45 
 
 
276 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  62.55 
 
 
276 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  46.04 
 
 
273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.86 
 
 
261 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  35.63 
 
 
245 aa  166  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.13 
 
 
275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.09 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.06 
 
 
275 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.06 
 
 
271 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.05 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.09 
 
 
266 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  34.39 
 
 
269 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.75 
 
 
280 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.39 
 
 
275 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.87 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.86 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.2 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.18 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.78 
 
 
530 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.95 
 
 
240 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  42.86 
 
 
245 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.91 
 
 
237 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.03 
 
 
274 aa  122  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.96 
 
 
248 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.89 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.89 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.48 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  28.73 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.16 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  32.89 
 
 
264 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.71 
 
 
259 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  34.39 
 
 
281 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.39 
 
 
278 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.11 
 
 
261 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.67 
 
 
278 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  26.81 
 
 
363 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.78 
 
 
269 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.16 
 
 
268 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0174196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.66 
 
 
344 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.84 
 
 
269 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  33.93 
 
 
242 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.74 
 
 
329 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 
268 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.3 
 
 
268 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  34.95 
 
 
258 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  26.37 
 
 
358 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.2 
 
 
246 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.64 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.51 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  38.12 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  27.34 
 
 
364 aa  97.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.34 
 
 
343 aa  96.3  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.27 
 
 
329 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  25.27 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  25.27 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  25.27 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  25.27 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  25.27 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  25.27 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  25.27 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.93 
 
 
240 aa  94  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  25.27 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.73 
 
 
349 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  25.27 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  26.28 
 
 
349 aa  92.4  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.74 
 
 
358 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.91 
 
 
329 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.45 
 
 
372 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.01 
 
 
329 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  26.43 
 
 
352 aa  90.5  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  32.89 
 
 
219 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  33.05 
 
 
250 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  25.62 
 
 
356 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.62 
 
 
356 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.37 
 
 
349 aa  89.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.81 
 
 
360 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.16 
 
 
366 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.24 
 
 
344 aa  86.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  34.48 
 
 
235 aa  85.5  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.82 
 
 
365 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  27.27 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  34.05 
 
 
248 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  34.52 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  26.88 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.24 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.92 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>