132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0897 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  30.74 
 
 
326 aa  129  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.49 
 
 
327 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.9 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.21 
 
 
345 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  33.17 
 
 
325 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.02 
 
 
329 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  34.43 
 
 
337 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.05 
 
 
329 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  33.2 
 
 
245 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  30.38 
 
 
328 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  29.55 
 
 
334 aa  108  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.58 
 
 
328 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.58 
 
 
328 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  35.35 
 
 
332 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.41 
 
 
334 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  32.23 
 
 
338 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  32.23 
 
 
338 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  32.23 
 
 
338 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  32.23 
 
 
338 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  32.23 
 
 
338 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  32.23 
 
 
338 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  33.64 
 
 
339 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  30.73 
 
 
332 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  27.2 
 
 
336 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.23 
 
 
338 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  30.12 
 
 
334 aa  102  5e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  30.05 
 
 
333 aa  102  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  26.36 
 
 
334 aa  102  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  34.85 
 
 
338 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  34.85 
 
 
338 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  34.85 
 
 
338 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  32.23 
 
 
338 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1000  lipoate-protein ligase A  32 
 
 
338 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.36 
 
 
329 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  32.58 
 
 
338 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  28.63 
 
 
329 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  31.75 
 
 
562 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  28.63 
 
 
329 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  28.63 
 
 
329 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  28.63 
 
 
329 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  28.63 
 
 
329 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  28.63 
 
 
329 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  28.63 
 
 
329 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  28.63 
 
 
329 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  32.1 
 
 
332 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  31.28 
 
 
338 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  26.56 
 
 
331 aa  99.4  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  31.28 
 
 
338 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  31.28 
 
 
338 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  31.28 
 
 
338 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.22 
 
 
329 aa  98.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  28.22 
 
 
329 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  32.55 
 
 
338 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4933  lipoate-protein ligase A  31.28 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.46 
 
 
343 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  30.94 
 
 
337 aa  95.9  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.8 
 
 
329 aa  95.9  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  30.04 
 
 
338 aa  95.1  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  26.83 
 
 
331 aa  94.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  26.05 
 
 
329 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58727  predicted protein  32.09 
 
 
475 aa  90.5  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0291322 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.73 
 
 
329 aa  89.4  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.81 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.16 
 
 
349 aa  86.3  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  26.7 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  25.29 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.59 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  28.92 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.28 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  25.28 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  25.28 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  25.28 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  25.28 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  25.28 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  25.28 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  25.28 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  26.03 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  30.73 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  27.67 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.84 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.35 
 
 
530 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.45 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  27.45 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.95 
 
 
360 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.69 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.77 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.49 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  26.47 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05732  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06950)  32.65 
 
 
437 aa  72  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  27.38 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.06 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.12 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.15 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.85 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.13 
 
 
358 aa  68.6  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.87 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>