23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3968 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3968  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0262  biotin/lipoate A/B protein ligase  55.96 
 
 		 237 aa  192  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0487982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0267  biotin/lipoate A/B protein ligase  61.05 
 
 		 237 aa  192  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0440  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.15 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.491162 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  29.75 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.25 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.25 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.67 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  30 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  30 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  30 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  30 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  30 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  30 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  30 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  30 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  30 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  30 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.29 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.19 
 
 		 245 aa  48.5  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.57 
 
 		 278 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.75 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1254  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.87 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>