74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1796 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  100 
 
 		 511 aa  1051    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  64.1 
 
 		 500 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  71.12 
 
 		 503 aa  749    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  64.48 
 
 		 499 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  64.75 
 
 		 503 aa  646    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  81.94 
 
 		 505 aa  830    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  68.47 
 
 		 499 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  73.72 
 
 		 574 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  64.33 
 
 		 541 aa  687    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  79.37 
 
 		 504 aa  830    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.59 
 
 		 501 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  68.32 
 
 		 505 aa  716    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  66.53 
 
 		 506 aa  690    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  80.36 
 
 		 505 aa  842    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  74.7 
 
 		 505 aa  785    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  71.71 
 
 		 502 aa  752    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  76.74 
 
 		 503 aa  809    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  85.15 
 
 		 505 aa  873    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.62 
 
 		 497 aa  614  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  61.75 
 
 		 499 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  60.76 
 
 		 517 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  60.76 
 
 		 517 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  60.76 
 
 		 517 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  60.59 
 
 		 502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  60.2 
 
 		 521 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  59.96 
 
 		 611 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  55.22 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  55.93 
 
 		 539 aa  568  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  54.72 
 
 		 536 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.37 
 
 		 534 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  52.11 
 
 		 545 aa  529  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  52.26 
 
 		 529 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  48.6 
 
 		 543 aa  505  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.24 
 
 		 497 aa  501  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  48.31 
 
 		 562 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  48.39 
 
 		 575 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  40.36 
 
 		 555 aa  350  5e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  47.68 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.4 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  44.55 
 
 		 452 aa  320  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  44.55 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.72 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  43.72 
 
 		 453 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  43.34 
 
 		 454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  46.7 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.1 
 
 		 452 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.96 
 
 		 452 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  42.62 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  42.62 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  45.88 
 
 		 452 aa  309  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  43.34 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  43.1 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  45.88 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.08 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.37 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.36 
 
 		 455 aa  299  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.65 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.93 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  41.16 
 
 		 454 aa  296  8e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  41.06 
 
 		 452 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  41.2 
 
 		 462 aa  289  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  41.2 
 
 		 452 aa  289  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.89 
 
 		 452 aa  287  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  41.16 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  41.16 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.13 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  41.16 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  40.44 
 
 		 452 aa  286  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.44 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.07 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.63 
 
 		 690 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  43.01 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  35.48 
 
 		 486 aa  256  6e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  35.48 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>