74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.66 
 
 		 543 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  69.49 
 
 		 545 aa  696    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  100 
 
 		 529 aa  1062    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.48 
 
 		 535 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  60.68 
 
 		 534 aa  593  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  56.38 
 
 		 541 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  54.78 
 
 		 505 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  56.78 
 
 		 521 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  53.11 
 
 		 502 aa  526  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  56.2 
 
 		 502 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  55.81 
 
 		 611 aa  522  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  53.01 
 
 		 504 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  52.26 
 
 		 511 aa  521  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  52.91 
 
 		 503 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  56.2 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  52.24 
 
 		 505 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  56.2 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  53.01 
 
 		 505 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  56.2 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  52.63 
 
 		 574 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  54.65 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  51.89 
 
 		 501 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  52.55 
 
 		 500 aa  510  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.76 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  54.61 
 
 		 497 aa  507  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  52.08 
 
 		 503 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.5 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  52.35 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  52.54 
 
 		 499 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  50.36 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.2 
 
 		 503 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  50.84 
 
 		 506 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  49.36 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  51.81 
 
 		 562 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  44.46 
 
 		 575 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  44.8 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  40 
 
 		 555 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  38.42 
 
 		 452 aa  269  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  39.14 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.66 
 
 		 452 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  38.19 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  38.42 
 
 		 452 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  38.33 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.06 
 
 		 457 aa  261  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  37.56 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  38.19 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.23 
 
 		 453 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  38.9 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  38.19 
 
 		 452 aa  256  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.19 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  38.19 
 
 		 452 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.95 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.36 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.39 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  35.89 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.39 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.34 
 
 		 453 aa  248  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  37.5 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  37.03 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.6 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  37.03 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  37.03 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  37.26 
 
 		 462 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  38.22 
 
 		 464 aa  243  7.999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.09 
 
 		 447 aa  243  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  36.79 
 
 		 452 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  35.87 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.28 
 
 		 452 aa  238  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.82 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.08 
 
 		 447 aa  230  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  37.75 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.7 
 
 		 459 aa  229  9e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.69 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  35.08 
 
 		 690 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>