74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16190 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  100 
 
 		 562 aa  1109    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  51.26 
 
 		 535 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  51.16 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  47.51 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  47.74 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  49.82 
 
 		 575 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  48.79 
 
 		 534 aa  445  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  46.79 
 
 		 502 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  47.85 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  46.47 
 
 		 543 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  46.86 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  45.55 
 
 		 500 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  47.36 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  46.23 
 
 		 506 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  50.86 
 
 		 529 aa  432  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  46.69 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  46.78 
 
 		 505 aa  432  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  46.21 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  46.42 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  46.77 
 
 		 545 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  46.88 
 
 		 574 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  47.53 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  49.23 
 
 		 502 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  48.79 
 
 		 521 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  49.01 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  49.01 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  49.01 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  48.79 
 
 		 611 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  46.77 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  46.77 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  44.44 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  45.28 
 
 		 503 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  44.98 
 
 		 536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  45.17 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  48.56 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.06 
 
 		 497 aa  368  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  38.33 
 
 		 555 aa  310  4e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.23 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.16 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  43.42 
 
 		 452 aa  276  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  41.99 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  41.99 
 
 		 447 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  41.99 
 
 		 447 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.71 
 
 		 447 aa  276  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  41.93 
 
 		 453 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  41.99 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  42.3 
 
 		 452 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  42.93 
 
 		 452 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  42.41 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  42.71 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  43.12 
 
 		 452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  42.41 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  41.36 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  42.93 
 
 		 452 aa  270  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.41 
 
 		 457 aa  269  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.94 
 
 		 447 aa  268  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.64 
 
 		 455 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  41.47 
 
 		 452 aa  266  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  40.62 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.76 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  41.88 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.23 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.68 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  40 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.09 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.75 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.36 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.37 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  42.44 
 
 		 464 aa  248  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.57 
 
 		 459 aa  247  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.26 
 
 		 455 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.44 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.9 
 
 		 690 aa  240  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  38.53 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>