74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1497 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  100 
 
 
452 aa  927    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.45 
 
 
454 aa  640    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  92.92 
 
 
452 aa  871    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  75.44 
 
 
452 aa  720    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  82.08 
 
 
452 aa  775    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  82.12 
 
 
453 aa  784    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  74.12 
 
 
452 aa  699    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  82.96 
 
 
452 aa  786    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  76.6 
 
 
453 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  72.35 
 
 
452 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  73.23 
 
 
452 aa  693    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  82.3 
 
 
452 aa  777    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  71.36 
 
 
447 aa  666    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  72.57 
 
 
452 aa  695    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  87.17 
 
 
452 aa  821    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  68.14 
 
 
455 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  68.27 
 
 
457 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  81.72 
 
 
454 aa  772    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  87.83 
 
 
452 aa  828    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  71.9 
 
 
452 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  72.48 
 
 
447 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  70.64 
 
 
453 aa  669    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  66.67 
 
 
454 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  80.97 
 
 
452 aa  772    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  83.19 
 
 
452 aa  785    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  80.31 
 
 
452 aa  762    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  80.35 
 
 
453 aa  755    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  71.81 
 
 
447 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  87.83 
 
 
452 aa  826    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  72.35 
 
 
462 aa  693    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  71.81 
 
 
447 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.59 
 
 
455 aa  620  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.78 
 
 
690 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.33 
 
 
459 aa  584  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  52.97 
 
 
464 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  48.04 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  49.86 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  47.31 
 
 
504 aa  319  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  48.08 
 
 
503 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  44.79 
 
 
505 aa  312  9e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  43.1 
 
 
511 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.93 
 
 
505 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  40.97 
 
 
486 aa  310  5e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  44.69 
 
 
517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  44.69 
 
 
517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  44.69 
 
 
517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  41.61 
 
 
505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  41.32 
 
 
500 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  40.78 
 
 
574 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  40.68 
 
 
611 aa  300  5e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  44.2 
 
 
521 aa  299  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  41.99 
 
 
502 aa  299  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  40.92 
 
 
502 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  45.33 
 
 
503 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.85 
 
 
501 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.46 
 
 
499 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.58 
 
 
497 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  40.68 
 
 
506 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.02 
 
 
499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.31 
 
 
541 aa  282  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  41 
 
 
535 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  43.41 
 
 
505 aa  280  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  43.41 
 
 
499 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  43.16 
 
 
562 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.43 
 
 
534 aa  276  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.62 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.5 
 
 
503 aa  269  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.29 
 
 
543 aa  263  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  40.11 
 
 
536 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  38.66 
 
 
529 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.38 
 
 
539 aa  253  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.41 
 
 
545 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  39.68 
 
 
575 aa  239  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  33.57 
 
 
555 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>