74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3075 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  92.42 
 
 
611 aa  928    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  94.41 
 
 
517 aa  946    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  95.42 
 
 
502 aa  962    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  100 
 
 
521 aa  1052    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  94.41 
 
 
517 aa  946    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  82.5 
 
 
499 aa  831    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  79 
 
 
497 aa  772    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.67 
 
 
503 aa  666    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  94.41 
 
 
517 aa  946    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  70.92 
 
 
500 aa  728    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  72.17 
 
 
499 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  63.04 
 
 
501 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  60.79 
 
 
505 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  59.17 
 
 
506 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  60.76 
 
 
499 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  59.41 
 
 
511 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  59 
 
 
574 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.57 
 
 
505 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  59.33 
 
 
505 aa  594  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  59.6 
 
 
502 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  59.8 
 
 
505 aa  594  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  60 
 
 
503 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.57 
 
 
505 aa  591  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  58.81 
 
 
504 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  59.64 
 
 
503 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  56.69 
 
 
541 aa  561  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  56.78 
 
 
529 aa  533  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.76 
 
 
535 aa  526  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  52.59 
 
 
545 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.27 
 
 
534 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  48.97 
 
 
543 aa  495  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  50.38 
 
 
536 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  50.75 
 
 
539 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  50.1 
 
 
497 aa  449  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  46.81 
 
 
562 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  46.24 
 
 
575 aa  425  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  37.54 
 
 
555 aa  351  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.16 
 
 
452 aa  300  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  39.95 
 
 
452 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  40.62 
 
 
452 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  41.11 
 
 
452 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  40.87 
 
 
452 aa  294  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.81 
 
 
452 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  40.53 
 
 
453 aa  292  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  40.62 
 
 
452 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  40.67 
 
 
454 aa  291  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  39.66 
 
 
452 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.9 
 
 
452 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  40.19 
 
 
452 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.62 
 
 
454 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.19 
 
 
452 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  39.71 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  39.52 
 
 
454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.62 
 
 
453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.57 
 
 
453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.66 
 
 
452 aa  283  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.43 
 
 
457 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  41.19 
 
 
452 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  41.19 
 
 
447 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  41.19 
 
 
447 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.59 
 
 
455 aa  279  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  41.19 
 
 
452 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  40.92 
 
 
462 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  39.53 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.57 
 
 
453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.14 
 
 
452 aa  274  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  37.95 
 
 
452 aa  274  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.74 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.47 
 
 
447 aa  270  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.85 
 
 
690 aa  261  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.61 
 
 
459 aa  260  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  37.75 
 
 
464 aa  259  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  40.79 
 
 
486 aa  242  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  35.6 
 
 
473 aa  209  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>