74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12132 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.96 
 
 
457 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  75.22 
 
 
452 aa  715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  71.52 
 
 
453 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  79.65 
 
 
452 aa  777    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  71.46 
 
 
452 aa  679    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  71.3 
 
 
453 aa  686    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  82.74 
 
 
452 aa  794    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  75.22 
 
 
452 aa  726    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  932    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  75.22 
 
 
452 aa  716    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  88.37 
 
 
447 aa  836    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  94.69 
 
 
452 aa  895    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  74.34 
 
 
452 aa  702    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  72.57 
 
 
452 aa  688    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  94.41 
 
 
447 aa  882    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  94.69 
 
 
462 aa  895    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  73.01 
 
 
452 aa  693    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  94.41 
 
 
447 aa  882    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  76.16 
 
 
453 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  72.12 
 
 
452 aa  686    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  74.56 
 
 
452 aa  704    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  73.45 
 
 
452 aa  699    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.84 
 
 
453 aa  640    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  87.25 
 
 
447 aa  822    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  94.47 
 
 
452 aa  891    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  74.34 
 
 
452 aa  704    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  69.82 
 
 
454 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  73.23 
 
 
452 aa  693    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  65.93 
 
 
455 aa  631  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.23 
 
 
454 aa  633  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  65.56 
 
 
454 aa  631  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  64.75 
 
 
690 aa  596  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.17 
 
 
455 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  59.96 
 
 
459 aa  568  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  49.89 
 
 
464 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  48.07 
 
 
473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  41.59 
 
 
486 aa  323  3e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  44.5 
 
 
504 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.1 
 
 
500 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  45.18 
 
 
505 aa  295  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  40.44 
 
 
511 aa  285  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  41.16 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.34 
 
 
499 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.29 
 
 
505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.4 
 
 
505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  35.98 
 
 
505 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  42.39 
 
 
506 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  38.55 
 
 
517 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  38.55 
 
 
517 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  38.55 
 
 
517 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.05 
 
 
503 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  38.19 
 
 
611 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  37.95 
 
 
521 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.95 
 
 
497 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  37.71 
 
 
502 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  35.5 
 
 
574 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.08 
 
 
503 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  41.99 
 
 
505 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  40.05 
 
 
502 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  41.47 
 
 
562 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  41.21 
 
 
499 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.98 
 
 
499 aa  262  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.64 
 
 
497 aa  260  4e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.98 
 
 
501 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.82 
 
 
534 aa  255  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.21 
 
 
535 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.14 
 
 
541 aa  253  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  38.27 
 
 
536 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.62 
 
 
539 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.79 
 
 
529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  35.08 
 
 
543 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.48 
 
 
545 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.83 
 
 
575 aa  216  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  31.83 
 
 
555 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>