74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2428 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  69.47 
 
 		 455 aa  685    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.41 
 
 		 690 aa  641    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  68.65 
 
 		 454 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  80.79 
 
 		 452 aa  780    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  74.17 
 
 		 452 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  80.79 
 
 		 452 aa  771    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  100 
 
 		 453 aa  932    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  74.61 
 
 		 452 aa  703    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  81.24 
 
 		 452 aa  784    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  77.92 
 
 		 453 aa  765    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  71.08 
 
 		 452 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  71.52 
 
 		 452 aa  687    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  80.57 
 
 		 452 aa  770    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  70.54 
 
 		 447 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  71.52 
 
 		 452 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  85.43 
 
 		 452 aa  810    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  83.26 
 
 		 452 aa  792    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  82.12 
 
 		 452 aa  784    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  81.5 
 
 		 454 aa  780    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  84.99 
 
 		 452 aa  813    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  71.08 
 
 		 452 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  72.32 
 
 		 447 aa  680    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  72.85 
 
 		 453 aa  706    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  67.55 
 
 		 454 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  81.46 
 
 		 452 aa  780    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  70.98 
 
 		 447 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  81.06 
 
 		 452 aa  778    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  81.24 
 
 		 453 aa  777    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  70.98 
 
 		 447 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  85.43 
 
 		 452 aa  816    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  71.3 
 
 		 462 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  70.46 
 
 		 457 aa  686    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.45 
 
 		 455 aa  618  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.78 
 
 		 459 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  53.39 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  45.69 
 
 		 473 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  45.41 
 
 		 505 aa  326  7e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  47.06 
 
 		 504 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  43.72 
 
 		 511 aa  318  9e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  40.27 
 
 		 486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  44.55 
 
 		 503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  41.4 
 
 		 505 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.2 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  42.13 
 
 		 574 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.13 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.26 
 
 		 503 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.72 
 
 		 499 aa  293  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.19 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.36 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  39.29 
 
 		 517 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  39.29 
 
 		 517 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  39.29 
 
 		 517 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  39.62 
 
 		 521 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  38.61 
 
 		 611 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.61 
 
 		 497 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  41.02 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  43.87 
 
 		 505 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.13 
 
 		 535 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  38.44 
 
 		 502 aa  279  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  38.44 
 
 		 506 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.74 
 
 		 499 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.31 
 
 		 541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  39.61 
 
 		 499 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.67 
 
 		 534 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.52 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.8 
 
 		 503 aa  270  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  41.09 
 
 		 562 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.99 
 
 		 529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.7 
 
 		 545 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.5 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  39.19 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.46 
 
 		 539 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  39.41 
 
 		 575 aa  239  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  32.59 
 
 		 555 aa  190  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>