74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1836 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  80.36 
 
 
511 aa  842    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  64.61 
 
 
503 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  68.47 
 
 
499 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  73.07 
 
 
574 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  87.9 
 
 
505 aa  891    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.96 
 
 
541 aa  673    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  65.07 
 
 
500 aa  662    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  68.51 
 
 
505 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  89.29 
 
 
504 aa  920    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  67 
 
 
501 aa  687    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  66.53 
 
 
506 aa  697    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  78.04 
 
 
503 aa  822    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  73.47 
 
 
505 aa  781    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  76.1 
 
 
503 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.08 
 
 
499 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  79.92 
 
 
505 aa  809    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1043    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  74.3 
 
 
502 aa  786    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  60.88 
 
 
499 aa  606  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  60.55 
 
 
611 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  59.44 
 
 
517 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  59.44 
 
 
517 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  59.44 
 
 
517 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  59.8 
 
 
521 aa  596  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  60 
 
 
502 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  57.09 
 
 
535 aa  596  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  60.36 
 
 
497 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  55.09 
 
 
536 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  55.83 
 
 
539 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  54.72 
 
 
534 aa  548  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  52.29 
 
 
545 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  52.44 
 
 
529 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  49.91 
 
 
543 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  52.85 
 
 
497 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  46.78 
 
 
562 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  47.78 
 
 
575 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  40.48 
 
 
555 aa  345  1e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  45.41 
 
 
454 aa  334  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  49.33 
 
 
452 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  45.17 
 
 
452 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  49.19 
 
 
455 aa  329  6e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  49.86 
 
 
452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  45.41 
 
 
452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  46.02 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  45.52 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  45.63 
 
 
452 aa  326  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  45.41 
 
 
453 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  44.47 
 
 
452 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  44.44 
 
 
452 aa  323  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  47.98 
 
 
452 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  47.97 
 
 
452 aa  322  7e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  48.1 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.52 
 
 
457 aa  319  9e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.21 
 
 
453 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  41.14 
 
 
455 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.96 
 
 
452 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  46.17 
 
 
452 aa  309  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  41.65 
 
 
454 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  45.73 
 
 
462 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  46.01 
 
 
447 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  46.01 
 
 
452 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  46.01 
 
 
447 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  45.73 
 
 
452 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.65 
 
 
454 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  44.85 
 
 
452 aa  297  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  45.8 
 
 
452 aa  296  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  45.18 
 
 
452 aa  296  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  44.81 
 
 
447 aa  293  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  38 
 
 
459 aa  293  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  44.35 
 
 
447 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  44.86 
 
 
690 aa  276  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  36.89 
 
 
486 aa  270  5e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  41.47 
 
 
464 aa  266  8e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.36 
 
 
473 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>