74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1206 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  100 
 
 
459 aa  946    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  72.41 
 
 
455 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  69.43 
 
 
457 aa  648    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.91 
 
 
453 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.86 
 
 
453 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  64.1 
 
 
454 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.37 
 
 
690 aa  608  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  63.88 
 
 
454 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.78 
 
 
453 aa  598  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  63.22 
 
 
452 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  63.66 
 
 
452 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.33 
 
 
452 aa  584  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  61.89 
 
 
452 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  63.22 
 
 
452 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  63.44 
 
 
452 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  61.89 
 
 
452 aa  585  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  62.33 
 
 
452 aa  584  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  61.89 
 
 
452 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  63.22 
 
 
452 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  61.89 
 
 
453 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  60.39 
 
 
452 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  59.96 
 
 
462 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  60.18 
 
 
452 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  61.67 
 
 
452 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  61.89 
 
 
452 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  62.11 
 
 
452 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  60.57 
 
 
452 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  59.96 
 
 
452 aa  568  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  59.96 
 
 
447 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  59.96 
 
 
447 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  60.39 
 
 
454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  60.79 
 
 
447 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  59.29 
 
 
447 aa  551  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  57.14 
 
 
455 aa  522  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  51.43 
 
 
464 aa  442  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  48.93 
 
 
473 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  43.02 
 
 
486 aa  319  7e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  37.55 
 
 
504 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  38 
 
 
505 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  37.6 
 
 
505 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  36.47 
 
 
574 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  42.27 
 
 
502 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  37.07 
 
 
511 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  39.04 
 
 
500 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  37 
 
 
505 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.29 
 
 
503 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  37.12 
 
 
503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.87 
 
 
505 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  39.47 
 
 
517 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  39.47 
 
 
517 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  39.47 
 
 
517 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.72 
 
 
499 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  42.51 
 
 
505 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.44 
 
 
501 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  38.61 
 
 
611 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  42.23 
 
 
499 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  38.37 
 
 
502 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  38.61 
 
 
521 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  35.77 
 
 
497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.32 
 
 
535 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.78 
 
 
497 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  40.55 
 
 
506 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  38.57 
 
 
562 aa  247  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.61 
 
 
503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.65 
 
 
499 aa  246  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  39.35 
 
 
536 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.66 
 
 
541 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  38.02 
 
 
575 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.62 
 
 
534 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.53 
 
 
545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.7 
 
 
539 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  37.7 
 
 
529 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  35.56 
 
 
543 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  31.6 
 
 
555 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>