74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3131 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  72.14 
 
 
499 aa  718    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  71.29 
 
 
500 aa  734    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.6 
 
 
503 aa  666    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  100 
 
 
517 aa  1044    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  93.63 
 
 
611 aa  932    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  79.03 
 
 
497 aa  776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  83.53 
 
 
499 aa  838    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  94.41 
 
 
521 aa  947    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1044    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1044    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  95.21 
 
 
502 aa  953    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  63.13 
 
 
501 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  60.96 
 
 
505 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  61.37 
 
 
499 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  59.84 
 
 
511 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  59.33 
 
 
506 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  60.04 
 
 
504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.55 
 
 
505 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  59.41 
 
 
574 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  59.8 
 
 
505 aa  598  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.55 
 
 
505 aa  598  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  60.16 
 
 
503 aa  598  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  59.44 
 
 
505 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  59.28 
 
 
502 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  59.92 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  55.37 
 
 
541 aa  551  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  54.03 
 
 
535 aa  529  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  56.01 
 
 
529 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  51.85 
 
 
545 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.56 
 
 
534 aa  508  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  50.58 
 
 
536 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  51.13 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  48.04 
 
 
543 aa  491  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  49.7 
 
 
497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  47.01 
 
 
562 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  47.2 
 
 
575 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  37.48 
 
 
555 aa  345  8e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  44.69 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  44.14 
 
 
452 aa  307  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  41.02 
 
 
452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  41.26 
 
 
452 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  41.02 
 
 
452 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  41.06 
 
 
454 aa  302  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  41.02 
 
 
452 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  41.2 
 
 
452 aa  300  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  40.05 
 
 
452 aa  300  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.73 
 
 
454 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  40.44 
 
 
453 aa  296  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  40.62 
 
 
454 aa  296  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.01 
 
 
452 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  40.1 
 
 
452 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  39.85 
 
 
452 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.1 
 
 
452 aa  293  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.95 
 
 
453 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.87 
 
 
455 aa  290  6e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.29 
 
 
453 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  41.92 
 
 
452 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  41.92 
 
 
452 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.38 
 
 
455 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  41.92 
 
 
447 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  41.92 
 
 
447 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.56 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.33 
 
 
457 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  41.64 
 
 
462 aa  286  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.19 
 
 
453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.59 
 
 
447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  38.55 
 
 
452 aa  282  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.1 
 
 
452 aa  280  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.31 
 
 
447 aa  279  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.95 
 
 
690 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  38.26 
 
 
464 aa  269  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.47 
 
 
459 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  40.26 
 
 
486 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  35.93 
 
 
473 aa  220  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>