74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  100 
 
 		 455 aa  933    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  71.46 
 
 		 690 aa  670    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.04 
 
 		 454 aa  639    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  67.92 
 
 		 452 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  69.25 
 
 		 452 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  69.47 
 
 		 453 aa  685    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  67.26 
 
 		 452 aa  641    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  68.81 
 
 		 452 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  69.91 
 
 		 453 aa  683    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  72.41 
 
 		 459 aa  679    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  69.25 
 
 		 452 aa  661    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  66.15 
 
 		 452 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  69.25 
 
 		 452 aa  666    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  66.37 
 
 		 447 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  82.46 
 
 		 457 aa  780    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  69.47 
 
 		 452 aa  656    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  68.14 
 
 		 452 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  68.87 
 
 		 454 aa  656    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  69.47 
 
 		 452 aa  671    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  66.59 
 
 		 452 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  82.3 
 
 		 453 aa  776    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  67.04 
 
 		 454 aa  641    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  66.15 
 
 		 462 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  69.25 
 
 		 452 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  68.58 
 
 		 452 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  69.47 
 
 		 453 aa  667    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  66.37 
 
 		 447 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  69.03 
 
 		 452 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  65.93 
 
 		 452 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.15 
 
 		 452 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.26 
 
 		 447 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.71 
 
 		 452 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.26 
 
 		 447 aa  616  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  57.74 
 
 		 455 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  52.53 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  48.48 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  41.5 
 
 		 486 aa  321  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  41.98 
 
 		 504 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  41.36 
 
 		 505 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.03 
 
 		 505 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.72 
 
 		 503 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  38.31 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.27 
 
 		 499 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.63 
 
 		 505 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  39.82 
 
 		 503 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  39.56 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  39.33 
 
 		 574 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  40.38 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  40.38 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  40.38 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.19 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.48 
 
 		 499 aa  279  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.65 
 
 		 497 aa  279  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  39.57 
 
 		 611 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.97 
 
 		 501 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  39.06 
 
 		 502 aa  275  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.15 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  39.53 
 
 		 521 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.02 
 
 		 503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  39.43 
 
 		 502 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  37.26 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  38 
 
 		 506 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.77 
 
 		 535 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  39.95 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.23 
 
 		 541 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.86 
 
 		 534 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.26 
 
 		 562 aa  246  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.6 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  34.98 
 
 		 543 aa  236  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.22 
 
 		 545 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.94 
 
 		 539 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.62 
 
 		 575 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  37.57 
 
 		 536 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  29.74 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>