74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2174 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  85.07 
 
 
539 aa  935    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1093    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  56.03 
 
 
541 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  54.91 
 
 
505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  55.47 
 
 
504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  54.72 
 
 
511 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  54.34 
 
 
574 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  55.01 
 
 
503 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  55.09 
 
 
505 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  53.51 
 
 
502 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  55.37 
 
 
505 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  54.82 
 
 
505 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  54.25 
 
 
503 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  54.44 
 
 
505 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  53.7 
 
 
499 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.59 
 
 
535 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  54.47 
 
 
501 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  51.13 
 
 
506 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  52.29 
 
 
534 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  52.64 
 
 
503 aa  502  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  50.68 
 
 
500 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  49.91 
 
 
529 aa  495  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  51.64 
 
 
611 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  50.87 
 
 
517 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  50.67 
 
 
521 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  50.87 
 
 
517 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  50.87 
 
 
517 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  51.06 
 
 
502 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  51.75 
 
 
497 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  50.38 
 
 
499 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  49.32 
 
 
499 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  49.08 
 
 
545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  46.44 
 
 
543 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  48.63 
 
 
575 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  47.9 
 
 
497 aa  432  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  44.98 
 
 
562 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  39.23 
 
 
555 aa  347  5e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  43.82 
 
 
455 aa  278  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  40.54 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  40.7 
 
 
452 aa  269  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  39.73 
 
 
452 aa  266  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.24 
 
 
452 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.11 
 
 
452 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  37.35 
 
 
452 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.11 
 
 
452 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  36.87 
 
 
452 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  36.45 
 
 
454 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.93 
 
 
454 aa  256  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  39.02 
 
 
452 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.19 
 
 
453 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  38.75 
 
 
452 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  38.48 
 
 
452 aa  249  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  38.75 
 
 
452 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.35 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  38.27 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  38.27 
 
 
452 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  38.01 
 
 
462 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  38.01 
 
 
447 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  38.01 
 
 
447 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  38.01 
 
 
452 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.46 
 
 
457 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.7 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  38.61 
 
 
453 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.47 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.7 
 
 
453 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  38.24 
 
 
464 aa  236  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.13 
 
 
452 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  37.37 
 
 
452 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.2 
 
 
452 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.98 
 
 
453 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  37.57 
 
 
455 aa  230  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.67 
 
 
690 aa  210  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  35.32 
 
 
473 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  37.27 
 
 
486 aa  197  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>