74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2178 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.67 
 
 
452 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  95.81 
 
 
454 aa  900    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  66.23 
 
 
452 aa  641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.45 
 
 
452 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.55 
 
 
453 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  67.33 
 
 
452 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.11 
 
 
453 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  67.04 
 
 
455 aa  641    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.86 
 
 
457 aa  640    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  65.56 
 
 
452 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  67.77 
 
 
453 aa  648    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.11 
 
 
452 aa  643    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  66.23 
 
 
452 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  66.67 
 
 
452 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  931    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.78 
 
 
453 aa  639    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  65.12 
 
 
462 aa  631  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.12 
 
 
452 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  65.34 
 
 
452 aa  632  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  65.56 
 
 
452 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.55 
 
 
452 aa  631  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  65.56 
 
 
452 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  65.12 
 
 
452 aa  628  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  64.46 
 
 
452 aa  630  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  65.62 
 
 
447 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  64.46 
 
 
452 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  65.62 
 
 
447 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.07 
 
 
447 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  64.24 
 
 
452 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.18 
 
 
447 aa  617  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  63.88 
 
 
454 aa  615  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  63.88 
 
 
459 aa  610  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.08 
 
 
690 aa  586  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  58.28 
 
 
455 aa  549  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  58.15 
 
 
464 aa  512  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  48.49 
 
 
473 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  42 
 
 
486 aa  324  3e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  41.65 
 
 
504 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  41.65 
 
 
505 aa  302  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  41.16 
 
 
511 aa  296  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  40.62 
 
 
517 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  40.62 
 
 
517 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  40.62 
 
 
517 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.44 
 
 
503 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.96 
 
 
497 aa  293  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.92 
 
 
505 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  41.4 
 
 
503 aa  289  9e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  39.66 
 
 
500 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.45 
 
 
541 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.66 
 
 
499 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  40 
 
 
502 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.05 
 
 
499 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  40.82 
 
 
499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  40 
 
 
611 aa  286  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  43.41 
 
 
505 aa  285  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  39.52 
 
 
521 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  36.59 
 
 
505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.86 
 
 
505 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.15 
 
 
501 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.95 
 
 
535 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  38.93 
 
 
574 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  40.92 
 
 
502 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  38.59 
 
 
506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.16 
 
 
503 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.67 
 
 
534 aa  262  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40 
 
 
562 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.24 
 
 
545 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.52 
 
 
539 aa  261  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  36.45 
 
 
536 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.75 
 
 
543 aa  246  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  34.96 
 
 
497 aa  246  9e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  35.89 
 
 
529 aa  243  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  36.73 
 
 
575 aa  235  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  29.71 
 
 
555 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>