74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2461 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  73.8 
 
 		 499 aa  733    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  71.94 
 
 		 500 aa  738    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.6 
 
 		 503 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  83.53 
 
 		 517 aa  837    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  100 
 
 		 499 aa  1011    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  81.47 
 
 		 611 aa  819    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  82.5 
 
 		 521 aa  832    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  79.28 
 
 		 497 aa  773    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  83.53 
 
 		 517 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  83.53 
 
 		 517 aa  837    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  63.75 
 
 		 501 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  82.31 
 
 		 502 aa  829    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  62.55 
 
 		 502 aa  617  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  60.6 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  60.68 
 
 		 505 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  61.75 
 
 		 511 aa  611  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  62.15 
 
 		 503 aa  608  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  60.88 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  61.04 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  63.75 
 
 		 505 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  60.88 
 
 		 504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  59.84 
 
 		 574 aa  601  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  63.94 
 
 		 505 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  58.88 
 
 		 506 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  60.32 
 
 		 503 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  55.87 
 
 		 541 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  53.01 
 
 		 535 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  54.46 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  52.6 
 
 		 534 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  50.94 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  50.47 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  49.16 
 
 		 543 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  50.37 
 
 		 545 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  50 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  47.2 
 
 		 575 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  44.85 
 
 		 562 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1972  putative proteasome component  40.73 
 
 		 555 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  41.79 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  41.71 
 
 		 452 aa  296  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.46 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  40.92 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  41.16 
 
 		 452 aa  291  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.77 
 
 		 454 aa  289  9e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  39.66 
 
 		 454 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  40.44 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.59 
 
 		 455 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  42.37 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  40.98 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  40 
 
 		 452 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.98 
 
 		 452 aa  282  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  40.68 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  40.19 
 
 		 452 aa  280  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.72 
 
 		 455 aa  279  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.74 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.44 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  39.95 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.98 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.77 
 
 		 457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.95 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  39.42 
 
 		 452 aa  273  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.8 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.41 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  40.16 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  40.16 
 
 		 447 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  40.16 
 
 		 447 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  40.33 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  37.98 
 
 		 452 aa  262  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  40.33 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  40.86 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.5 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.94 
 
 		 690 aa  250  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.65 
 
 		 459 aa  246  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  38.32 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  34.73 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>