85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5073 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_5073  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  100 
 
 		 599 aa  1234    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 		 795 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 		 795 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 780 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2769  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 981 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0941  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 758 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 		 791 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  25.12 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  25.12 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  24.41 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1828  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 		 1007 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0944  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.98 
 
 		 529 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0917  hydrophobic amino acid uptake ABC-transporter  23.81 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5172  Extracellular ligand-binding receptor  22.99 
 
 		 547 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4967  Extracellular ligand-binding receptor  22.09 
 
 		 468 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  67.39 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 576 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 		 813 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 375 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  21.51 
 
 		 381 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1977  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 432 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  23.81 
 
 		 405 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1959  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 405 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  22.12 
 
 		 383 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1153  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.74 
 
 		 371 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0253  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.74 
 
 		 371 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 		 383 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  26.49 
 
 		 371 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  26.49 
 
 		 371 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  24.04 
 
 		 381 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  26.49 
 
 		 371 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 380 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 375 aa  47.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 384 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 380 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  22.31 
 
 		 386 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  20.5 
 
 		 401 aa  47.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 383 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.45 
 
 		 402 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 372 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 372 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.86 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.73 
 
 		 376 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.86 
 
 		 384 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.43 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.43 
 
 		 378 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.49 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  24.43 
 
 		 372 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.73 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.43 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.73 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.73 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.43 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  24.43 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.43 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 384 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 384 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2462  Extracellular ligand-binding receptor  20.27 
 
 		 373 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.109923 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 372 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  22.84 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 382 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 384 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0065  Extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 		 392 aa  44.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  21.94 
 
 		 381 aa  44.3  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.73 
 
 		 380 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  25.41 
 
 		 371 aa  44.3  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.73 
 
 		 380 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.73 
 
 		 380 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  22.73 
 
 		 380 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 383 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 384 aa  43.9  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 		 393 aa  43.5  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>