More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4967 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4967  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
468 aa  945    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  49.64 
 
 
471 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  44.68 
 
 
471 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  44.68 
 
 
471 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  41.37 
 
 
813 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
791 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
795 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
795 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0941  serine/threonine protein kinase  29.16 
 
 
758 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5172  Extracellular ligand-binding receptor  31.8 
 
 
547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
1007 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 
780 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2769  extracellular ligand-binding receptor  27.55 
 
 
981 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0944  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.89 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0917  hydrophobic amino acid uptake ABC-transporter  29.73 
 
 
529 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1828  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
576 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  29.51 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.22 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.89 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1842  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843132  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
419 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  28.03 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  28.03 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.99 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  22.59 
 
 
376 aa  67  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
386 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  22.6 
 
 
383 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.84 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
375 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
380 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2462  Extracellular ligand-binding receptor  32.65 
 
 
373 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.109923 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
383 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  27.54 
 
 
371 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  27.54 
 
 
371 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 
378 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  27.54 
 
 
371 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2232  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 
373 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 
400 aa  63.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.8 
 
 
380 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.8 
 
 
380 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.8 
 
 
380 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2534  extracellular ligand-binding receptor  35.65 
 
 
374 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
376 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 
374 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
378 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
378 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2757  Extracellular ligand-binding receptor  35.65 
 
 
374 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.77 
 
 
376 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.19 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.19 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  24.19 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
373 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
373 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
378 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.59 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.44 
 
 
385 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 
368 aa  62.4  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.27 
 
 
395 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4810  extracellular ligand-binding receptor  32.19 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.88 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.89 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.89 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.89 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  32.89 
 
 
372 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.89 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5073  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  22.09 
 
 
599 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
599 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.89 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  32.89 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
372 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
372 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 
400 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  31.29 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>