129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1828 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1828  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
512 aa  1046    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0941  serine/threonine protein kinase  30.75 
 
 
758 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
471 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
471 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 
813 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
471 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 
791 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 
795 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 
795 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0917  hydrophobic amino acid uptake ABC-transporter  28.92 
 
 
529 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0944  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.92 
 
 
529 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5172  Extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
547 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4967  Extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 
468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 
780 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 
1007 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2769  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 
981 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5073  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  24.02 
 
 
599 aa  73.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
576 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
401 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  27.95 
 
 
336 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
401 aa  64.3  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
400 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
371 aa  60.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  27.31 
 
 
399 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 
384 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
370 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0110  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 
384 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0620  extracellular ligand-binding receptor  24.91 
 
 
398 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
384 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
384 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 
384 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
369 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 
382 aa  53.5  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.13 
 
 
384 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.31 
 
 
380 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 
380 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 
380 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  26.46 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.92 
 
 
402 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
391 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
391 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  23.68 
 
 
376 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.46 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.46 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.46 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.46 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.46 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.46 
 
 
376 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.27 
 
 
380 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 
386 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 
380 aa  51.2  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
380 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
380 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  25.69 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.94 
 
 
378 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0065  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.56 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  27.56 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.42 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  30.26 
 
 
386 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.56 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  27.56 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.56 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.56 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.34 
 
 
371 aa  47.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  19.42 
 
 
372 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  25.11 
 
 
398 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 
373 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 
380 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  22.07 
 
 
373 aa  47  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  22.07 
 
 
373 aa  47  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  19.39 
 
 
399 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  22.31 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  22.31 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
417 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.04 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.14 
 
 
388 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  19.06 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  21.67 
 
 
373 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  19.06 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  24.04 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  24.04 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
380 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  21.6 
 
 
373 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  19.06 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>