181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2769 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2769  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
981 aa  2030    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0941  serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
758 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  31.77 
 
 
795 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
795 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
791 aa  204  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
471 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
471 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
780 aa  177  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  31.35 
 
 
471 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4967  Extracellular ligand-binding receptor  27.55 
 
 
468 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
813 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 
1007 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5172  Extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 
547 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1828  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 
512 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2762  hypothetical protein  56.44 
 
 
500 aa  105  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.978933  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5073  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  26.74 
 
 
599 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 
1818 aa  98.6  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0944  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.42 
 
 
529 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0917  hydrophobic amino acid uptake ABC-transporter  26.74 
 
 
529 aa  87.8  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.86 
 
 
393 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
576 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
377 aa  59.3  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0110  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
380 aa  58.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  27.52 
 
 
372 aa  57.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
375 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  32.9 
 
 
372 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
373 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
373 aa  56.2  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  22.6 
 
 
413 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
380 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  25.18 
 
 
378 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  20.45 
 
 
371 aa  55.1  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  22.6 
 
 
374 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 
358 aa  54.7  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.98 
 
 
380 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 
378 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  31.19 
 
 
371 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 
397 aa  54.3  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  31.19 
 
 
371 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  31.19 
 
 
371 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 
378 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
370 aa  54.3  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
372 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 
378 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 
386 aa  53.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
417 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.32 
 
 
399 aa  52.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 
375 aa  52.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
372 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
372 aa  53.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
372 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
372 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
378 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
372 aa  52.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
371 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  32.04 
 
 
383 aa  52  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.62 
 
 
382 aa  51.6  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
400 aa  51.6  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  22.59 
 
 
370 aa  51.6  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 
386 aa  51.6  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  30.97 
 
 
372 aa  51.2  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  29.68 
 
 
371 aa  51.2  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03309  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  25.29 
 
 
367 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 
377 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03262  hypothetical protein  25.29 
 
 
367 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  29.36 
 
 
371 aa  50.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.29 
 
 
367 aa  50.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  25 
 
 
1581 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 
369 aa  50.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0256  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
367 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3659  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.29 
 
 
367 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  30.63 
 
 
386 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3743  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.29 
 
 
367 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0255  Extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
367 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
416 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  19.81 
 
 
394 aa  50.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  28.68 
 
 
373 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  23.48 
 
 
1186 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4780  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.29 
 
 
367 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
376 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  24.33 
 
 
376 aa  50.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1109  Extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 
387 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3942  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.29 
 
 
367 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  20 
 
 
388 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
371 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 
371 aa  49.7  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.68 
 
 
393 aa  49.7  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 
401 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
419 aa  49.3  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
372 aa  49.7  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
393 aa  49.7  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  20.68 
 
 
386 aa  49.7  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3769  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.29 
 
 
365 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 
371 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3879  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.29 
 
 
367 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
384 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3836  leucine-specific-binding protein  25.29 
 
 
365 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3759  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.29 
 
 
367 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
373 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
371 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>