60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2118 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  100 
 
 
412 aa  788    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  70.98 
 
 
416 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  70.32 
 
 
433 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  73.9 
 
 
415 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  62.01 
 
 
410 aa  484  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  55.9 
 
 
414 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  51.73 
 
 
409 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  51.09 
 
 
417 aa  360  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  50.87 
 
 
445 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  50.62 
 
 
569 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  49.62 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  48.87 
 
 
402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  48.13 
 
 
448 aa  332  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  49.38 
 
 
597 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  45.52 
 
 
425 aa  325  7e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  49.25 
 
 
559 aa  325  9e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  46.37 
 
 
522 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  46.42 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  45.32 
 
 
448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  48.38 
 
 
435 aa  319  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  44.17 
 
 
469 aa  318  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  43.55 
 
 
521 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  46.83 
 
 
479 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  45.06 
 
 
557 aa  312  6.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  46.57 
 
 
673 aa  309  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  46.77 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  46.77 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  46.77 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2431  hypothetical protein  46.31 
 
 
465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0436145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12744  hypothetical protein  46.6 
 
 
450 aa  298  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64322  normal  0.329555 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15260  protein of unknown function (DUF349)  43.07 
 
 
565 aa  294  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.119422  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  47.19 
 
 
610 aa  292  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3965  hypothetical protein  45.89 
 
 
468 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  41.22 
 
 
512 aa  269  7e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  43.43 
 
 
407 aa  259  7e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  41.28 
 
 
599 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  39.47 
 
 
486 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  39.43 
 
 
456 aa  238  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
944 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  26.61 
 
 
626 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  25.81 
 
 
589 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  24.03 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  27.14 
 
 
757 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  29.3 
 
 
963 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5235  protein of unknown function DUF349  26.37 
 
 
425 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809819  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  25.9 
 
 
610 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  27.23 
 
 
634 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  24.79 
 
 
905 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4120  hypothetical protein  22.83 
 
 
426 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2325  hypothetical protein  29.08 
 
 
292 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  20.51 
 
 
659 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  23.92 
 
 
733 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2903  hypothetical protein  29.93 
 
 
948 aa  57  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00602685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4952  hypothetical protein  29.92 
 
 
884 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  27.31 
 
 
898 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3096  hypothetical protein  27.96 
 
 
974 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  22.54 
 
 
932 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  39.66 
 
 
968 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3631  hypothetical protein  30.71 
 
 
951 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  41.27 
 
 
920 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>