54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0461 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  925    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  73.1 
 
 		 435 aa  522  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  51.39 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  48.24 
 
 		 433 aa  333  5e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  46.68 
 
 		 425 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  49.37 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  48.49 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  48.49 
 
 		 448 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  46.13 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  45.31 
 
 		 673 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  46.04 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  46.55 
 
 		 407 aa  312  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  46.56 
 
 		 522 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  47.29 
 
 		 459 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  47.29 
 
 		 459 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  47.29 
 
 		 459 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  45.52 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  43.53 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  44.44 
 
 		 409 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3965  hypothetical protein  46.77 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2431  hypothetical protein  42.39 
 
 		 465 aa  296  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  46.83 
 
 		 412 aa  293  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12744  hypothetical protein  44.17 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64322  normal  0.329555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  44.25 
 
 		 414 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  48.99 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  43.6 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  42.89 
 
 		 569 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  41.73 
 
 		 559 aa  237  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  38.12 
 
 		 521 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  38.7 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  40.93 
 
 		 610 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  38.81 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  40.15 
 
 		 597 aa  227  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  38.46 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15260  protein of unknown function (DUF349)  34.87 
 
 		 565 aa  206  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.119422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  37.01 
 
 		 486 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  32.92 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  35.9 
 
 		 599 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 944 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  31.61 
 
 		 626 aa  81.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  27.34 
 
 		 589 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  24.64 
 
 		 659 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  26.42 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  22.12 
 
 		 733 aa  70.1  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2325  hypothetical protein  30.32 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  26.5 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  25.51 
 
 		 757 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  21.78 
 
 		 610 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5235  protein of unknown function DUF349  30.7 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  34.25 
 
 		 932 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  28.8 
 
 		 815 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  23.81 
 
 		 968 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  32.14 
 
 		 905 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4120  hypothetical protein  21.07 
 
 		 426 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>