45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01264 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  100 
 
 		 968 aa  1954    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  29.69 
 
 		 932 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  23.86 
 
 		 905 aa  220  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  24.02 
 
 		 920 aa  104  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  25.52 
 
 		 815 aa  101  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  25.61 
 
 		 963 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3096  hypothetical protein  24.82 
 
 		 974 aa  67  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  33.09 
 
 		 425 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  27.62 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  30.18 
 
 		 659 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 944 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2656  hypothetical protein  24.58 
 
 		 940 aa  60.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.984496  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  41.18 
 
 		 597 aa  55.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4952  hypothetical protein  24.7 
 
 		 884 aa  55.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2903  hypothetical protein  24.91 
 
 		 948 aa  55.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00602685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  23.62 
 
 		 898 aa  54.3  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  30.83 
 
 		 435 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  24.9 
 
 		 445 aa  53.5  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2041  hypothetical protein  23.55 
 
 		 889 aa  53.5  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  24.86 
 
 		 733 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  33.81 
 
 		 416 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  24.22 
 
 		 895 aa  52.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  27.34 
 
 		 486 aa  52.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  24.48 
 
 		 459 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  24.48 
 
 		 459 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  24.48 
 
 		 459 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  24.9 
 
 		 417 aa  51.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  30.46 
 
 		 448 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  24.71 
 
 		 610 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3631  hypothetical protein  24.32 
 
 		 951 aa  49.7  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  23.56 
 
 		 410 aa  48.9  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  28.48 
 
 		 469 aa  48.5  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  30.43 
 
 		 407 aa  47.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  27.82 
 
 		 610 aa  47.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  22.65 
 
 		 589 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  26.98 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  27.93 
 
 		 626 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15260  protein of unknown function (DUF349)  36 
 
 		 565 aa  45.8  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.119422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  39.66 
 
 		 412 aa  45.8  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  25.99 
 
 		 433 aa  45.8  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  31.88 
 
 		 415 aa  45.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2325  hypothetical protein  23.71 
 
 		 292 aa  45.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.96 
 
 		 728 aa  45.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  23.81 
 
 		 479 aa  44.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  27.46 
 
 		 402 aa  44.3  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>