34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2871 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2903  hypothetical protein  79.98 
 
 		 948 aa  1380    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00602685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2041  hypothetical protein  56.44 
 
 		 889 aa  875    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3096  hypothetical protein  58.26 
 
 		 974 aa  901    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4952  hypothetical protein  59.22 
 
 		 884 aa  686    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3631  hypothetical protein  58.78 
 
 		 951 aa  860    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  56.2 
 
 		 895 aa  873    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  100 
 
 		 963 aa  1897    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2656  hypothetical protein  59.33 
 
 		 940 aa  923    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.984496  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  56.77 
 
 		 898 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  27.47 
 
 		 815 aa  80.9  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 944 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  27.47 
 
 		 932 aa  69.7  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  25.61 
 
 		 968 aa  64.7  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  26.4 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  26.92 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  27.43 
 
 		 597 aa  55.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  27.36 
 
 		 412 aa  55.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  26.09 
 
 		 425 aa  55.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  27.22 
 
 		 456 aa  54.7  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  21.37 
 
 		 905 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  27.9 
 
 		 486 aa  53.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  25.88 
 
 		 521 aa  52.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  25.88 
 
 		 920 aa  52.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  25.19 
 
 		 569 aa  52  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  25.09 
 
 		 557 aa  52  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  25.28 
 
 		 410 aa  51.2  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  24.88 
 
 		 626 aa  50.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  26.74 
 
 		 402 aa  50.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  27.01 
 
 		 402 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  25 
 
 		 483 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  28.19 
 
 		 559 aa  50.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  26.91 
 
 		 416 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  24.45 
 
 		 589 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  22.7 
 
 		 512 aa  44.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>