52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3910 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  100 
 
 		 522 aa  1023    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  53.94 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  49.89 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  51.75 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  50.12 
 
 		 673 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  50.38 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  51.12 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  49.63 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2431  hypothetical protein  51.82 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  53.3 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  50.89 
 
 		 459 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  50.89 
 
 		 459 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  50.89 
 
 		 459 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3965  hypothetical protein  48.17 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12744  hypothetical protein  48.06 
 
 		 450 aa  339  9e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64322  normal  0.329555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  49.75 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  44.69 
 
 		 416 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  43.9 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  47.64 
 
 		 414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  44.64 
 
 		 409 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  43.95 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  46.19 
 
 		 412 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  43.98 
 
 		 410 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  45.01 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  42.28 
 
 		 569 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  43.52 
 
 		 610 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  46.42 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  41.4 
 
 		 417 aa  266  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  41.77 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  42.75 
 
 		 559 aa  258  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  35.29 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  37.32 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  37.44 
 
 		 557 aa  238  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15260  protein of unknown function (DUF349)  36.13 
 
 		 565 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.119422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  36.5 
 
 		 512 aa  229  7e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  36.36 
 
 		 599 aa  229  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  34.98 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  34.31 
 
 		 456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 944 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  28.97 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  25.34 
 
 		 733 aa  74.7  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  22.22 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  25.11 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  23.79 
 
 		 634 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2325  hypothetical protein  28.11 
 
 		 292 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  23.74 
 
 		 757 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  25.79 
 
 		 932 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  20.85 
 
 		 659 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  27.68 
 
 		 610 aa  54.7  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  32.28 
 
 		 920 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  34.31 
 
 		 533 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5041  hypothetical protein  50.88 
 
 		 162 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>