52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2205 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  897    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  897    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  897    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2431  hypothetical protein  73.23 
 
 
465 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0436145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3965  hypothetical protein  77.62 
 
 
468 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12744  hypothetical protein  71.6 
 
 
450 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64322  normal  0.329555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  59.26 
 
 
448 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  60.15 
 
 
469 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  56.31 
 
 
445 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  54.93 
 
 
448 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  51.29 
 
 
673 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  46.45 
 
 
522 aa  339  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  47.62 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  49.25 
 
 
402 aa  325  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  48.85 
 
 
402 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  46.06 
 
 
416 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  51.34 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  47.29 
 
 
479 aa  302  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  43.67 
 
 
409 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  46.7 
 
 
433 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  42.26 
 
 
569 aa  280  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  44.42 
 
 
414 aa  279  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  45.63 
 
 
410 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  45.59 
 
 
412 aa  276  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  43.04 
 
 
407 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  46.24 
 
 
415 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  45.11 
 
 
610 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  41.46 
 
 
417 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  38.95 
 
 
483 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  43.75 
 
 
559 aa  247  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  42.58 
 
 
597 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  40.22 
 
 
521 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  37.77 
 
 
557 aa  233  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  37.07 
 
 
512 aa  226  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15260  protein of unknown function (DUF349)  34.71 
 
 
565 aa  225  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.119422  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  36.22 
 
 
599 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  36.49 
 
 
486 aa  209  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  33.79 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
944 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  27.88 
 
 
757 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  28 
 
 
626 aa  81.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  25.27 
 
 
589 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  26.18 
 
 
634 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  22.96 
 
 
659 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  23.46 
 
 
610 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2325  hypothetical protein  24.61 
 
 
292 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  23.27 
 
 
932 aa  57.4  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  25.13 
 
 
430 aa  57  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  19.93 
 
 
733 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  23.95 
 
 
968 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  27.12 
 
 
920 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  23.83 
 
 
905 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>