63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0120 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
944 aa  1817    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  31.82 
 
 
589 aa  140  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  30.99 
 
 
626 aa  130  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  31.97 
 
 
610 aa  117  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  31.7 
 
 
445 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  31.75 
 
 
757 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  34.11 
 
 
425 aa  114  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  32.21 
 
 
673 aa  111  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  36.7 
 
 
402 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  34.38 
 
 
407 aa  108  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  29.72 
 
 
634 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12744  hypothetical protein  35.14 
 
 
450 aa  107  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64322  normal  0.329555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  28.09 
 
 
659 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  29.02 
 
 
733 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  33.33 
 
 
469 aa  103  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  31 
 
 
599 aa  103  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  31.56 
 
 
448 aa  102  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  29.66 
 
 
479 aa  101  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  32.08 
 
 
448 aa  98.6  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3965  hypothetical protein  34.04 
 
 
468 aa  98.2  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  38.71 
 
 
409 aa  97.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2431  hypothetical protein  32.23 
 
 
465 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0436145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  38.76 
 
 
402 aa  96.3  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  31.46 
 
 
459 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  31.46 
 
 
459 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  31.46 
 
 
459 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  31.48 
 
 
610 aa  94.7  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  33.16 
 
 
414 aa  94.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  28.1 
 
 
435 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  34.05 
 
 
433 aa  89.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  33.85 
 
 
417 aa  89.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  38.41 
 
 
522 aa  87.8  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  32.8 
 
 
569 aa  85.1  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  33.33 
 
 
483 aa  83.2  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  31.1 
 
 
456 aa  83.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  31.94 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5235  protein of unknown function DUF349  26.53 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809819  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  33.33 
 
 
559 aa  81.3  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  30.89 
 
 
521 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  30.06 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15260  protein of unknown function (DUF349)  30.65 
 
 
565 aa  79.7  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.119422  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  24.22 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  30.16 
 
 
410 aa  77  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  30.11 
 
 
512 aa  76.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  31.21 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  27.68 
 
 
932 aa  73.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  28.8 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  39.06 
 
 
597 aa  71.6  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2325  hypothetical protein  25.19 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  35.03 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  27.87 
 
 
963 aa  69.3  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  25.36 
 
 
905 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4120  hypothetical protein  24.32 
 
 
426 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3631  hypothetical protein  27.68 
 
 
951 aa  65.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  26.38 
 
 
920 aa  65.1  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  29.38 
 
 
815 aa  61.6  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2656  hypothetical protein  27.98 
 
 
940 aa  60.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.984496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3096  hypothetical protein  28.24 
 
 
974 aa  60.1  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  26.14 
 
 
898 aa  58.9  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  26.74 
 
 
968 aa  58.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2903  hypothetical protein  27.46 
 
 
948 aa  57.4  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00602685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2041  hypothetical protein  28.3 
 
 
889 aa  55.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  27.92 
 
 
895 aa  55.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>