55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1442 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  100 
 
 		 448 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  67.4 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  58.56 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  58.45 
 
 		 673 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  55.64 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3965  hypothetical protein  55.64 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  54.73 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  54.73 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  54.73 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2431  hypothetical protein  55.5 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  49.78 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12744  hypothetical protein  53.27 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64322  normal  0.329555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  48.93 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  54.68 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  54.43 
 
 		 402 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  48.38 
 
 		 409 aa  352  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  47.63 
 
 		 416 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  48.92 
 
 		 435 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  48.51 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  48.49 
 
 		 479 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  47.29 
 
 		 414 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  48.13 
 
 		 412 aa  316  7e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  45.39 
 
 		 410 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  46.15 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  46.38 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  43.98 
 
 		 569 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  44.58 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  44.75 
 
 		 597 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  42.47 
 
 		 610 aa  274  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  43.25 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  39.15 
 
 		 521 aa  259  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  39.01 
 
 		 557 aa  256  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  37.56 
 
 		 483 aa  247  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  38.71 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15260  protein of unknown function (DUF349)  37.32 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.119422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  41.02 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  35.61 
 
 		 599 aa  224  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  35.47 
 
 		 512 aa  223  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 944 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  30.37 
 
 		 626 aa  92.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  26.85 
 
 		 757 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  27.13 
 
 		 659 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  27.61 
 
 		 589 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  28.34 
 
 		 634 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  29.33 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  27.57 
 
 		 733 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  21.18 
 
 		 610 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2325  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5235  protein of unknown function DUF349  26.88 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  31.14 
 
 		 815 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  25.86 
 
 		 905 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  26.95 
 
 		 968 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  25.71 
 
 		 932 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4120  hypothetical protein  25.21 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  29.37 
 
 		 920 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>