62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2001 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  100 
 
 		 610 aa  1145    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  64.81 
 
 		 597 aa  465  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  58.25 
 
 		 569 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  52.07 
 
 		 483 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  59.76 
 
 		 559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  48.17 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  49.39 
 
 		 557 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  54.17 
 
 		 417 aa  372  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  42.65 
 
 		 599 aa  371  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  47.93 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  48.77 
 
 		 416 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  48.89 
 
 		 433 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  43.79 
 
 		 486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15260  protein of unknown function (DUF349)  39.96 
 
 		 565 aa  314  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.119422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  44.7 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  44.58 
 
 		 409 aa  310  6.999999999999999e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  47.63 
 
 		 410 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  39.95 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3965  hypothetical protein  43.48 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  40.53 
 
 		 522 aa  289  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  44.83 
 
 		 414 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  46.32 
 
 		 412 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  41.65 
 
 		 469 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  42.75 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2431  hypothetical protein  45.89 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  45.11 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  45.11 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  45.11 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  46.8 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  40.38 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  39.35 
 
 		 673 aa  266  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12744  hypothetical protein  43.62 
 
 		 450 aa  253  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64322  normal  0.329555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  41.12 
 
 		 479 aa  246  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  42.01 
 
 		 435 aa  233  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  40.29 
 
 		 402 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  40.2 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  38.01 
 
 		 425 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  35.38 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 944 aa  94  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  25.31 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  26.24 
 
 		 626 aa  74.7  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  23.24 
 
 		 610 aa  71.6  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  30.86 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  20.68 
 
 		 659 aa  70.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  20.76 
 
 		 733 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  25.68 
 
 		 589 aa  67  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32 
 
 		 2449 aa  62  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  44.44 
 
 		 848 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  23.29 
 
 		 430 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2325  hypothetical protein  22.22 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  56.06 
 
 		 517 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  32.91 
 
 		 932 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  36.9 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  26.19 
 
 		 3521 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  30.57 
 
 		 815 aa  51.6  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  42.53 
 
 		 607 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  26.2 
 
 		 3409 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  28.65 
 
 		 920 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  43.7 
 
 		 623 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  27.98 
 
 		 905 aa  47.4  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  27.82 
 
 		 968 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1929  hypothetical protein  42.39 
 
 		 372 aa  44.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000777643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>