54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0556 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  100 
 
 		 634 aa  1282    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  55.33 
 
 		 757 aa  711    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  33.5 
 
 		 589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  29.12 
 
 		 626 aa  194  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  24.71 
 
 		 733 aa  160  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  25.3 
 
 		 659 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  25 
 
 		 610 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 944 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  28.3 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  29.23 
 
 		 569 aa  84  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3965  hypothetical protein  29.9 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  28.5 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  29.21 
 
 		 445 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  27.59 
 
 		 448 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2431  hypothetical protein  26.99 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  28.7 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  28.57 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15260  protein of unknown function (DUF349)  31.9 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.119422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  26.18 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  27.19 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  26.18 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  26.18 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  28.21 
 
 		 610 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12744  hypothetical protein  27.23 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64322  normal  0.329555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  26.67 
 
 		 597 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  25.93 
 
 		 409 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  27.75 
 
 		 673 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  28.04 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  28.5 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  25.98 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  29.3 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  29.94 
 
 		 557 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  27.23 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  27.27 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  31.29 
 
 		 599 aa  63.9  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  25.84 
 
 		 402 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  23.79 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  27.16 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  26.5 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  27.51 
 
 		 414 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  26.23 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  23.96 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  23.92 
 
 		 932 aa  60.8  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  28.22 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  30.43 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  25.35 
 
 		 402 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  27.04 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  24.34 
 
 		 815 aa  50.8  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  23.05 
 
 		 898 aa  50.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4120  hypothetical protein  26.67 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  27.38 
 
 		 920 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2656  hypothetical protein  23.55 
 
 		 940 aa  48.5  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.984496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  28.1 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  22.08 
 
 		 895 aa  43.9  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>