21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2656 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2656  hypothetical protein  100 
 
 		 940 aa  1842    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.984496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  59.71 
 
 		 963 aa  982    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  68.91 
 
 		 898 aa  841    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2903  hypothetical protein  61.28 
 
 		 948 aa  975    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00602685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  61.99 
 
 		 895 aa  1001    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3631  hypothetical protein  62.86 
 
 		 951 aa  928    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3096  hypothetical protein  60.97 
 
 		 974 aa  948    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4952  hypothetical protein  62.6 
 
 		 884 aa  742    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2041  hypothetical protein  62.24 
 
 		 889 aa  1006    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  22.36 
 
 		 968 aa  66.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 944 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  27 
 
 		 932 aa  58.9  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  23.41 
 
 		 905 aa  57.4  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  26.24 
 
 		 569 aa  56.2  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  23.53 
 
 		 626 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  22.99 
 
 		 634 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  25.82 
 
 		 597 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  26.49 
 
 		 417 aa  48.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  21.65 
 
 		 757 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  26.2 
 
 		 920 aa  47  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  24.85 
 
 		 599 aa  45.8  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>