26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3631 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2656  hypothetical protein  64.06 
 
 
940 aa  982    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.984496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  59.48 
 
 
963 aa  984    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  73.28 
 
 
898 aa  853    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2903  hypothetical protein  60.15 
 
 
948 aa  949    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00602685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  67.53 
 
 
895 aa  1039    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3631  hypothetical protein  100 
 
 
951 aa  1842    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3096  hypothetical protein  70.58 
 
 
974 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4952  hypothetical protein  68.58 
 
 
884 aa  794    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2041  hypothetical protein  67.86 
 
 
889 aa  1035    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  27.68 
 
 
815 aa  77  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
944 aa  72  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  25.37 
 
 
932 aa  68.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  26.58 
 
 
589 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  29.89 
 
 
597 aa  55.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  22.08 
 
 
905 aa  53.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  21.58 
 
 
968 aa  51.6  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  26.92 
 
 
569 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  27.62 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  24.34 
 
 
626 aa  49.7  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  27.32 
 
 
417 aa  48.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  22.34 
 
 
634 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  23.2 
 
 
610 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  28.18 
 
 
559 aa  46.6  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  26.58 
 
 
599 aa  46.2  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  25.32 
 
 
920 aa  45.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  26.82 
 
 
410 aa  45.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>