28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2041 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2656  hypothetical protein  62.58 
 
 		 940 aa  984    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.984496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  63.75 
 
 		 963 aa  738    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3096  hypothetical protein  69.75 
 
 		 974 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  70.27 
 
 		 898 aa  1090    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2903  hypothetical protein  56.47 
 
 		 948 aa  904    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00602685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  98.76 
 
 		 895 aa  1695    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3631  hypothetical protein  67.49 
 
 		 951 aa  957    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4952  hypothetical protein  61.6 
 
 		 884 aa  967    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2041  hypothetical protein  100 
 
 		 889 aa  1715    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  27.75 
 
 		 932 aa  73.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 944 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  25.94 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  24.24 
 
 		 968 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  25.84 
 
 		 569 aa  55.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  26.8 
 
 		 599 aa  55.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  21.54 
 
 		 905 aa  54.7  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  22.14 
 
 		 634 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  24.74 
 
 		 626 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  24.34 
 
 		 589 aa  51.6  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  28.77 
 
 		 416 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  26.57 
 
 		 410 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  25.87 
 
 		 557 aa  47.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  26.64 
 
 		 559 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0425938 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  25.48 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  27.55 
 
 		 412 aa  46.2  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  23.02 
 
 		 757 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  26.17 
 
 		 521 aa  44.3  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  26.62 
 
 		 920 aa  44.3  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>